Portaalityöstökeskuksen tarkkuus on yksi keskeisistä suoritusindikaattoreista, joka vaikuttaa suoraan koneistettujen osien kokoon, muotoon ja paikannustarkkuuteen. Teknisestä näkökulmasta tarkkuuden määrää ensisijaisesti työstökoneen rakenne, käyttöjärjestelmä (kuten kuularuuvit ja lineaariohjaimet), karan suorituskyky ja CNC-järjestelmän ohjausominaisuudet. Korkean-tarkkuuspukkikoneistuskeskukset käyttävät tyypillisesti suljetun-silmukan tai puoli-suljetun-silmukan ohjausjärjestelmiä, joissa käytetään asteikkoa tai kooderia reaaliaikaisen-sijaintipalautteen antamiseen, mikä varmistaa paikannusvirheen ±0,005 mm:n tarkkuudella ja toistettavuuden jopa ±0,003 mm. Tarkkuuteen vaikuttavat tekijät voidaan luokitella mekaanisiin, sähköisiin ja ympäristöllisiin tekijöihin. Mekaanisesti ohjaustien suoruus ja karan säteittäinen juoksu (yleensä pienempi tai yhtä suuri kuin 0,002 mm) ja aksiaalinen välys (pienempi tai yhtä suuri kuin 0,001 mm) ovat tärkeitä. Sähköisesti servokäytön vastenopeus ja CNC-järjestelmän interpolointialgoritmi vaikuttavat suoraan dynaamiseen tarkkuuteen. Ympäristön kannalta lämpötilan vaihtelut (suositus ±2 asteen rajoissa), kosteus (40 %-60 %) ja lattiavärinä (vähemmän tai yhtä suuri kuin 5 μm) on valvottava tarkasti. Alan standardit edellyttävät, että huippuluokan pukkityöstökeskusten lineaarisen koordinaattien paikannustarkkuuden on oltava ISO 230-2 ja VDI/DGQ 3441 mukainen. Esimerkiksi koneessa, jonka työstöala on 1400 × 1350 mm, X/Y/Zura-akseli on tyypillisesti sama kuin paikannus. 0,01 mm/m, ja toistettavuus on pienempi tai yhtä suuri kuin 0,005 mm/m. Ilmailusovelluksissa ilmailu-avaruusosat (kuten terät ja kotelot) vaativat mikroni{32}tason tarkkuuden, kun taas muottikäsittelyssä painotetaan enemmän pinnan karheutta (Ra pienempi tai yhtä suuri kuin 0,8 μm) ja ääriviivojen tarkkuutta. Toimenpiteitä tarkkuuden parantamiseksi ovat asteikon säännöllinen kalibrointi (suositus kuuden kuukauden välein), erittäin tarkkojen kiinnittimien käyttö (kuten nollapisteen paikannusjärjestelmät), optimoidut leikkausparametrit (kuten karan nopeudet 8000-12000 rpm ja syöttönopeudet 1000-12000 rpm ja lämpötilan kompensointi 1000-3000 mm/min).
